U držitele osvědčení je průběžně, nejméně ale 1x za dva roky, ověřováno dodržování zásad správné laboratorní praxe a to Ministerstvem životního prostředí zřízenou právnickou osobou pro ověřování zásad (NIO SLP, Středisko pro posuzování způsobilosti laboratoří ASLAB, Výzkumný ústav vodohospodářský T. G. Masaryka, veřejná výzkumná instituce) formou periodických kontrol testovacího zařízení nebo auditu studií. Kontrola dodržování zásad u držitele osvědčení je možná i mimo periodickou kontrolu na žádost správního orgánu.
Omezení provozu zařízení ke skladování, sběru, úpravě, využití nebo odstranění odpadů krajským úřadem
KÚ může omezit provoz zařízení ke skladování, sběru, úpravě, využití nebo odstranění odpadů, pokud provozovatel tohoto zařízení neplní povinnosti stanovené tímto zákonem nebo rozhodnutím vydaným na základě tohoto zákona, a mohlo-li by v důsledku toho dojít k závažným nepříznivým dopadům na životní prostředí nebo zdraví lidí.